生化池中温度过低，导致菌种活性不高，污水处理分解能力下降；温度对硝化的影响明显，在低温条件下硝化细菌的繁殖速度降低，体内酶活力受到抑制，代谢速度会变得较慢。生化池中污泥的泥龄太长。
污水处理工艺中分段控制时间短，难控制。污水处理时硝化反应没有控制好PH等。例如：pH值过高会影响微生物的正常生长，增加水中游离氨的浓度抑制硝化菌。硝化菌还对重金属、酚、氰化物等有毒物质敏感。
客观因素影响，像有的亚热带季风气候城市，每年梅雨季节和汛期雨水尤为充沛。收集范围越广，短时间内污水处理进水水量变化系数越大，水量过度负荷，缩短了硝化停留时间。
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